由于工程的系统性强，比较复杂，因此，在施工初期，便要求施工单位上报总体施工进度计划、材料采购进场计划，并根据所报计划进行合理化分析并调整，调整完成后，要求施工单位严格按照计划执行。
建成的手术室是一个封闭环境，若在建成之后，因为有不方便使用的地方，或者无法达到实际的使用要求的地方，需要进行修改，那么便比较麻烦了。因此，层流手术室工程过程中，便应该邀请使用单位、科室护士定期到施工现场参观，并及时提出修改意见，对现场发现的使用不方便的地方进行及时修改，这样会带来三个好处：
1)避免竣工后不必要的修改;
2)工程竣工后，因为不需要太多的修改，可以很快投入使用;
3)在这个过程中，使用单位、科室护士也加深了对层流净化手术室的了解，便于以后的操作使用。
建成之后的层流手术室表面看起来很简单，但是，在顶棚、在夹皮墙之后，还有一些其他的地方，我们便能看到各类的净化设备、管线，密密麻麻，外行人肯定一时难以理出头绪。在层流手术室工程中，
1)要对吊顶内的各种管线综合排布，合理化划分;
2)对需要预埋的管线应提前考虑清楚;
3)夹皮墙要重点关注，除了合理分配设备位置之外，还要尽量预留出夹皮墙内的检修通道，方便以后通过检修口进出夹皮墙对各种管线进行检修;
4)设备层的施工也是很重要的，要特别注意空调机组的吊装顺序。
层流手术室工程投资大，难度大，因此，选择的净化工程公司要有科学合理的管理体系，从各个方面系统性的保障手术室工程的质量，以保证花出去的每一分钱都获得了应有的效益，而不是在整改、返工中被浪费。
